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細胞種屬鑒別檢測
生產細胞培養(yǎng)常有著相近的營養(yǎng)條件與環(huán)境因素,在傳代的培養(yǎng)過程中很容易發(fā)生細胞間交叉污染。法規(guī)要求了對細胞庫的種屬鑒定,主要目的在于:
① 確認細胞來源
② 防止交叉污染
③ 識別細胞變異
④ 幫助研究細胞進化和分化
總的來說,細胞種屬鑒別檢測在生物制品中的目的是確定所使用的細胞種屬,從而確保產品的質量、安全性和合規(guī)性。
基于此,我們利用多重PCR開發(fā)出用于10 種常見細胞的種屬鑒別(牛/豬/犬/小鼠/大鼠/中國倉鼠/非洲綠猴/恒河猴/貓/人)和種屬間細胞交叉污染的檢測試劑盒,也提供多種屬近百種細胞的動物細胞DNA條形碼試劑盒。另外,也可以選擇NGS技術平臺能一次性得到最全面的細胞庫信息。
細胞種屬鑒別檢測平臺
? 多重PCR:
細胞種屬鑒別檢測采用多重PCR檢測技術,搭配我們自主研發(fā)生產的檢測試劑盒,原理是利用常用物種的細胞線粒體上3 個相對保守的基因,設計出可同時檢測10 種常見細胞的種屬鑒別,靈敏度可達2 個細胞/反應,交叉污染檢測限至少達到1/1000 細胞污染的水平,擴增后搭配瓊脂糖凝膠電泳完成判斷,相較于同工酶法,檢測速度更快、靈敏度更高、試劑采購更容易,也比STR圖譜分析法所鑒別的種屬范圍更廣。
? DNA條形碼:
通過對物種特定DNA序列進行掃描和比較來鑒定不同細胞的生物物種的技術。
具體操作步驟包括:
① 選擇合適的DNA條形碼區(qū)域(COI)
② 前處理采用DNA免提取法
③ 序列分析
④ 數(shù)據(jù)解讀
此方法受到測序分辨率的限制,對細胞種屬間交叉污染檢測靈敏度較低,因此建議結合湖州申科多重PCR與NGS平臺,作進一步研究。
? NGS (二代測序):
通過NGS技術,對不同物種細胞DNA序列的高通量測序,利用比對算法將其與數(shù)據(jù)庫中已知物種DNA序列比對,從而確定待測樣本中可能存在的細胞種屬。
此外,還可以進行基于組裝和聚類的無參考基因組分析,對未知細胞種屬進行鑒定分類。
NGS可以一次性獲取下面訊息:
① 物種鑒定
② 種屬來源
③ 染色體大結構變化
④ 遺傳漂變
⑤ 外源因子污染
⑥ 種間污染
⑦ 種內污染
?? 樣品適用性驗證服務
針對樣品進行適用性驗證,搭配試劑盒全面性能驗證報告,確保檢測結果準確性與可信度。
? 精密度(重復性、中間精密度)驗證
? 樣品回收率(準確性)驗證
?? 樣品檢測服務
利用多重PCR、DNA條形碼和NGS等方法對客戶提供的樣品進行細胞種屬鑒別,出具相應的檢測報告。
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